Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm1Q8K377 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrrtm1Q8K377 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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