Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms