Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms