Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfm1Q8K0D5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms