Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms