Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrit1Q8K099 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit1Q8K099 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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