Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh2d5Q8JZW5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms