Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ago3Q8CJF9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms