Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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