Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SbsnQ8CIT9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SbsnQ8CIT9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SbsnQ8CIT9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SbsnQ8CIT9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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