Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Setd1bQ8CFT2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setd1bQ8CFT2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Setd1bQ8CFT2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms