Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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