Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras1Q8CEC5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms