Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms