Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxo48Q8CAT8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms