Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhsl1Q8CAF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhsl1Q8CAF4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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