Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms