Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms