Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms