Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcgF3Q8BTQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcgF3Q8BTQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms