Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms