Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abraxas1Q8BPZ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abraxas1Q8BPZ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms