Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap4Q8BMK4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms