Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms