Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem260Q8BMD6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms