Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms