Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnrc6bQ8BKI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms