Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144bQ8BKD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms