Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmd4aQ8BIE6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmd4aQ8BIE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms