Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4dQ8BGV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms