Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Best2Q8BGM5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms