Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Htatsf1Q8BGC0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htatsf1Q8BGC0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Htatsf1Q8BGC0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Htatsf1Q8BGC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htatsf1Q8BGC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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