Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pld4Q8BG07 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pld4Q8BG07 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms