Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd4Q8BFT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms