Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms