Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfascQ810U3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfascQ810U3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms