Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChfrQ810L3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms