Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pkhd1l1Q80ZA4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pkhd1l1Q80ZA4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Pkhd1l1Q80ZA4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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