Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TnnQ80Z71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TnnQ80Z71 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnnQ80Z71 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms