Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm5bQ80Y84 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm5bQ80Y84 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms