Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2bQ80XK6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms