Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms