Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NischQ80TM9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
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