Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms