Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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