Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tigd3Q7TM95 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms