Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms