Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms