Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih3Q6ZWS4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms