Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms